Publikasjoner
NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.
2020
Sammendrag
Endogenous antimicrobial peptides (AMPs) are evolutionarily ancient factors of innate immunity, which are produced by all multicellular organisms and play a key role in their protection against infection. Red king crab (Paralithodes camtschaticus), also called Kamchatka crab, is widely distributed and the best known species of all king crabs belonging to the family Lithodidae. Despite their economic importance, the genetic resources of king crabs are scarcely known and no fullgenome sequences are available to date. Therefore, analysis of the red king crab transcriptome and identifcation and characterization of its AMPs could potentially contribute to the development of novel antimicrobial drug candidates when antibiotic resistance has become a global health threat. In this study, we sequenced the P. camtschaticus transcriptomes from carapace, tail fap and leg tissues using an Illumina NGS platform. Libraries were systematically analyzed for gene expression profles along with AMP prediction. By an in silico approach using public databases we defned 49 cDNAs encoding for AMP candidates belonging to diverse families and functional classes, including buforins, crustins, paralithocins, and ALFs (anti-lipopolysaccharide factors). We analyzed expression patterns of 27 AMP genes. The highest expression was found for Paralithocin 1 and Crustin 3, with more than 8,000 reads. Other paralithocins, ALFs, crustins and ubiquicidins were among medium expressed genes. This transcriptome data set and AMPs provide a solid baseline for further functional analysis in P. camtschaticus. Results from the current study contribute also to the future application of red king crab as a bio-resource in addition to its being a known seafood delicacy.
2019
Forfattere
Cornelya Klutsch Vetle Schwensen Lindgren Thrond Oddvar Haugen Natalia Polikarpova Paul Eric Aspholm Ida Marie Bardalen Fløystad Kristin Forfang Simo Maduna Tommi Nyman Hans Geir Eiken Per-Arne Amundsen Snorre HagenSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Cornelya Klutsch Simo Maduna Natalia Polikarpova Kristin Forfang Paul Eric Aspholm Tommi Nyman Hans Geir Eiken Per-Arne Amundsen Snorre HagenSammendrag
Habitat discontinuity, anthropogenic disturbance, and overharvesting have led to population fragmentation and decline worldwide. Preservation of remaining natural genetic diversity is crucial to avoid continued genetic erosion. Brown trout (Salmo trutta L.) is an ideal model species for studying anthropogenic influences on genetic integrity, as it has experienced significant genetic alterations throughout its natural distribution range due to habitat fragmentation, overexploitation, translocations, and stocking. The Pasvik River is a subarctic riverine system shared between Norway, Russia, and Finland, subdivided by seven hydroelectric power dams that destroyed about 70% of natural spawning and nursing areas. Stocking is applied in certain river parts to support the natural brown trout population. Adjacent river segments with different management strategies (stocked vs. not stocked) facilitated the simultaneous assessment of genetic impacts of dams and stocking based on analyses of 16 short tandem repeat loci. Dams were expected to increase genetic differentiation between and reduce genetic diversity within river sections. Contrastingly, stocking was predicted to promote genetic homogenization and diversity, but also potentially lead to loss of private alleles and to genetic erosion. Our results showed comparatively low heterozygosity and clear genetic differentiation between adjacent sections in nonstocked river parts, indicating that dams prevent migration and contribute to genetic isolation and loss of genetic diversity. Furthermore, genetic differentiation was low and heterozygosity relatively high across stocked sections. However, in stocked river sections, we found signatures of recent bottlenecks and reductions in private alleles, indicating that only a subset of individuals contributes to reproduction, potentially leading to divergence away from the natural genetic state. Taken together, these results indicate that stocking counteracts the negative fragmentation effects of dams, but also that stocking practices should be planned carefully in order to ensure long‐term preservation of natural genetic diversity and integrity in brown trout and other species in regulated river systems.
Forfattere
Cornelya Klutsch Vetle Schwensen Lindgren Simo Maduna Natalia Polikarpova Tommi Nyman Paul Eric Aspholm Kristin Forfang Per-Arne Amundsen Thrond Oddvar Haugen Hans Geir Eiken Snorre HagenSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Cornelya Klutsch Vetle Schwensen Lindgren Simo Maduna Natalia Polikarpova Tommi Nyman Kristin Forfang Paul Eric Aspholm Per-Arne Amundsen Thrond Oddvar Haugen Hans Geir Eiken Snorre HagenSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Ida Marie Bardalen Fløystad Henrik Brøseth Beate Banken Bakke Hans Geir Eiken Snorre HagenSammendrag
Gjennom det nasjonale overvåkingsprogrammet for rovvilt i Norge ble det i 2018 samlet inn prøver til DNA analyse med antatt opphav fra brunbjørn (Ursus arctos) for tiende år på rad. Av de 1007 prøvene som ble samlet inn i 2018, ble 984 prøver inkludert i den genetiske analysen (720 ekskrementprøver, 252 hårprøver og 12 vevsprøver) og 53 % var positive for brunbjørn. Totalt gav 447 prøver (45 %) en full DNA-identitet, og det ble fra disse prøvene påvist 138 ulike bjørner; 63 hunnbjørner og 75 hannbjørner. Dette er en økning på 10 % (13 individer) sammen-lignet med 2017, mens kjønnsfordelingen bare har endret seg med 2% i samme periode. Dette er det høyeste antallet brunbjørn registrert siden 2013, og det høyeste antallet hunnbjørn regi-strert siden overvåkningen startet i 2009. Forekomsten av brunbjørn er hovedsakelig konsentrert i fylkene Finnmark (49), Hedmark (44) og Trøndelag (32) som tidligere. Av det totale antallet bjørner påvist i 2018 er 59 % (81 individer) tidligere påvist i Norge, noe som utgjør en reduksjon i gjenfunn på 6 % i forhold til i fjor. Dette er den laveste andelen gjenfunn siden 2009. Om man inkluderer gjenfunn fra Sverige, Finland og Russland utgjør det totale antallet gjenfunn 87 indi-vider (63 %). Estimatet for 2018 på 7,7 ynglinger er det høyeste anslaget siden overvåkningen startet i 2009, og er en økning fra 2017 hvor estimatet lå på 6,9 ynglinger. I rovviltregion 5 (Hedmark) ligger antallet estimerte ynglinger i år, som i fjor, over bestandsmålet på 3 årlige ynglinger. De andre rovviltregionene ligger under bestandsmålet i 2018.
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag